Los estudiantes aceptados al programa podrán postularse ante SECIHTI para recibir un estipendio mensual durante los 2 años de duración del programa bajo una estricta evaluación de su desempeño. Estas becas son otorgadas directamente por el SECIHTI bajo sus criterios y lineamientos vigentes (consultar https://secihti.mx/becas-nacionales/). Adicionalmente, La Universidad Autónoma de Querétaro otorga a los estudiantes de posgrado beneficiados con una beca SECIHTI la condonación de los costos por crédito.